Nejdříve si udělejte pořádek v sources.list, je dobré vyhodit extra repozitáře, udělat update. Poté příkazem

aptitude search '~i!~Oubuntu'

najděte všechny nestandardní balíky, které byly přidány z jiných zdrojů. Doporučuji odinstalovat ty, které nepoužíváte (jen jste zkoušeli) a ponechat minimum (skype, realplayer – skutečně jen základní věci). Toto můžete provést také přes grafický Synaptic-Stav-Zastaralé nebo lokální balíčky.

Dále jsem postupoval dle návodu: https://wiki.kubuntu.org/KubuntuUpgrade (update, dist-upgrade, instalace balíčku kubuntu-desktop, restart)

Během instalace se apt několikrát zeptal, zda má modifikovat nebo zachovat změněné konfigurační soubory.